蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）对正常细胞功能至关重要，并且与许多疾病途径有关。然而，只有4％的PPI用PTMS在诸如完整的生物知识数据库中的PTM，主要通过手动策策进行，这既不是时间也不是成本效益。我们使用完整的PPI数据库创建具有交互蛋白对，它们相应的PTM类型和来自PubMed数据库的相关摘要注释的远程监督数据集。我们训练Biobert Models的一组合 - 配音PPI-Biobert-X10，以提高置信度校准。我们利用集合平均置信度方法的使用，置信范围抵消了类别不平衡提取高信任预测的影响。在测试集上评估的PPI-BIOBERT-X10模型导致适用的F1-MICRO 41.3（P = 5 8.1，R = 32.1）。然而，通过结合高信心和低变化来识别高质量的预测，调整精度预测，我们保留了100％精度的19％的测试预测。我们评估了1800万PubMed摘要的PPI-Biobert-X10，提取了160万（546507个独特的PTM-PPI三联网）PTM-PPI预测，并过滤〜5700（4584个独一无二）的高信心预测。在5700中，对于小型随机采样的子集进行人体评估表明，尽管置信度校准，精度降至33.7％，并突出了即使在置信度校准的情况下超出了测试集中的最长途的挑战。我们仅包括与多个论文相关的预测的问题来规避问题，从而将精确提高到58.8％。在这项工作中，我们突出了深入学习的文本挖掘在实践中的利益和挑战，并且需要增加对置信校准的强调，以促进人类策划努力。
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This paper is a technical overview of DeepMind and Google's recent work on reinforcement learning for controlling commercial cooling systems. Building on expertise that began with cooling Google's data centers more efficiently, we recently conducted live experiments on two real-world facilities in partnership with Trane Technologies, a building management system provider. These live experiments had a variety of challenges in areas such as evaluation, learning from offline data, and constraint satisfaction. Our paper describes these challenges in the hope that awareness of them will benefit future applied RL work. We also describe the way we adapted our RL system to deal with these challenges, resulting in energy savings of approximately 9% and 13% respectively at the two live experiment sites.
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Large language models (LLMs) have been shown to be able to perform new tasks based on a few demonstrations or natural language instructions. While these capabilities have led to widespread adoption, most LLMs are developed by resource-rich organizations and are frequently kept from the public. As a step towards democratizing this powerful technology, we present BLOOM, a 176B-parameter open-access language model designed and built thanks to a collaboration of hundreds of researchers. BLOOM is a decoder-only Transformer language model that was trained on the ROOTS corpus, a dataset comprising hundreds of sources in 46 natural and 13 programming languages (59 in total). We find that BLOOM achieves competitive performance on a wide variety of benchmarks, with stronger results after undergoing multitask prompted finetuning. To facilitate future research and applications using LLMs, we publicly release our models and code under the Responsible AI License.
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The SNMMI Artificial Intelligence (SNMMI-AI) Summit, organized by the SNMMI AI Task Force, took place in Bethesda, MD on March 21-22, 2022. It brought together various community members and stakeholders from academia, healthcare, industry, patient representatives, and government (NIH, FDA), and considered various key themes to envision and facilitate a bright future for routine, trustworthy use of AI in nuclear medicine. In what follows, essential issues, challenges, controversies and findings emphasized in the meeting are summarized.
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最先进的（SOTA）深度学习乳房X线照片分类器接受了弱标记的图像训练，通常依赖于产生有限解释性预测的全球模型，这是他们成功地转化为临床实践的关键障碍。另一方面，基于原型的模型通过将预测与训练图像原型相关联，改善了可解释性，但是它们的准确性不如全球模型，其原型往往具有差的多样性。我们通过BraixProtopnet ++的建议解决了这两个问题，该问题通过将基于原型的模型结合起来，为全局模型增添了解释性。 BraixProtopnet ++在训练基于原型的模型以提高合奏的分类精度时，会提炼全局模型的知识。此外，我们提出了一种方法来通过保证所有原型都与不同的训练图像相关联，以增加原型多样性。对弱标记的私人和公共数据集进行的实验表明，BraixProtopnet ++的分类精度比基于SOTA Global和基于原型的模型具有更高的分类精度。使用病变定位来评估模型可解释性，我们显示BraixProtopnet ++比其他基于原型的模型和全球模型的事后解释更有效。最后，我们表明，BraixProtopnet ++学到的原型的多样性优于基于SOTA原型的方法。
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在分析筛查乳房X线照片时，放射科医生可以自然处理每个乳房的两个同侧视图，即颅底审计（CC）和中外侧 - 粘合剂（MLO）视图。这些多个相关图像提供了互补的诊断信息，并可以提高放射科医生的分类准确性。不幸的是，大多数现有的深度学习系统，受过全球标记的图像培训，缺乏从这些多种观点中共同分析和整合全球和本地信息的能力。通过忽略筛选发作的多个图像中存在的潜在有价值的信息，人们限制了这些系统的潜在准确性。在这里，我们提出了一种新的多视图全球分析方法，该方法基于全球一致性学习和对乳房X线照片中同侧观点的局部同时学习，模仿放射科医生的阅读程序。广泛的实验表明，在大规模的私人数据集和两个公开可用的数据集上，我们的模型在分类准确性和概括方面优于竞争方法，在该数据集和两个公开可用的数据集上，模型仅受到全球标签的培训和测试。
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通用数据模型解决了标准化电子健康记录（EHR）数据的许多挑战，但无法将其集成深度表型所需的资源。开放的生物学和生物医学本体论（OBO）铸造本体论提供了可用于生物学知识的语义计算表示，并能够整合多种生物医学数据。但是，将EHR数据映射到OBO Foundry本体论需要大量的手动策展和域专业知识。我们介绍了一个框架，用于将观察性医学成果合作伙伴关系（OMOP）标准词汇介绍给OBO铸造本体。使用此框架，我们制作了92,367条条件，8,615种药物成分和10,673个测量结果的映射。域专家验证了映射准确性，并且在24家医院进行检查时，映射覆盖了99％的条件和药物成分和68％的测量结果。最后，我们证明OMOP2OBO映射可以帮助系统地识别可能受益于基因检测的未诊断罕见病患者。
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3D多对象跟踪旨在唯一，始终如一地识别所有移动实体。尽管在此设置中提供了丰富的时空信息，但当前的3D跟踪方法主要依赖于抽象的信息和有限的历史记录，例如单帧对象边界框。在这项工作中，我们开发了对交通场景的整体表示，该场景利用了现场演员的空间和时间信息。具体而言，我们通过将跟踪的对象表示为时空点和边界框的序列来重新将跟踪作为时空问题，并在悠久的时间历史上进行重新制定。在每个时间戳上，我们通过对对象历史记录的完整顺序进行的细化来改善跟踪对象的位置和运动估计。通过共同考虑时间和空间，我们的代表自然地编码了基本的物理先验，例如对象持久性和整个时间的一致性。我们的时空跟踪框架在Waymo和Nuscenes基准测试中实现了最先进的性能。
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尽管电子健康记录是生物医学研究的丰富数据来源，但这些系统并未在医疗环境中统一地实施，并且由于医疗保健碎片化和孤立的电子健康记录之间缺乏互操作性，可能缺少大量数据。考虑到缺少数据的案例的删除可能会在随后的分析中引起严重的偏见，因此，一些作者更喜欢采用多重插补策略来恢复缺失的信息。不幸的是，尽管几项文献作品已经通过使用现在可以自由研究的任何不同的多个归档算法记录了有希望的结果，但尚无共识，MI算法效果最好。除了选择MI策略之外，归纳算法及其应用程序设置的选择也至关重要且具有挑战性。在本文中，受鲁宾和范布伦的开创性作品的启发，我们提出了一个方法学框架，可以应用于评估和比较多种多个插补技术，旨在选择用于计算临床研究工作中最有效的推断。我们的框架已被应用于验证和扩展较大的队列，这是我们在先前的文献研究中提出的结果，我们在其中评估了关键患者的描述符和Covid-19的影响在2型糖尿病患者中的影响，其数据为2型糖尿病，其数据为2型糖尿病由国家共同队列合作飞地提供。
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超越地球轨道的人类空间勘探将涉及大量距离和持续时间的任务。为了有效减轻无数空间健康危害，数据和空间健康系统的范式转移是实现地球独立性的，而不是Earth-Reliance所必需的。有希望在生物学和健康的人工智能和机器学习领域的发展可以解决这些需求。我们提出了一个适当的自主和智能精密空间健康系统，可以监控，汇总和评估生物医学状态;分析和预测个性化不良健康结果;适应并响应新累积的数据;并提供对其船员医务人员的个人深度空间机组人员和迭代决策支持的预防性，可操作和及时的见解。在这里，我们介绍了美国国家航空航天局组织的研讨会的建议摘要，以便在太空生物学和健康中未来的人工智能应用。在未来十年，生物监测技术，生物标志科学，航天器硬件，智能软件和简化的数据管理必须成熟，并编织成精确的空间健康系统，以使人类在深空中茁壮成长。
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